酸碱类物质：土壤的酸碱度对微生物多样性影响显著。当土壤中添加酸性或碱性物质时，会改变土壤的 pH 值。例如，酸雨会使土壤酸化，降低土壤 pH 值，抑制一些对酸性环境敏感的微生物生长，如放线菌，而可能使嗜酸的真菌等微生物相对增加。相反，过量施用石灰等碱性物质会使土壤碱化，同样会改变微生物群落结构，影响微生物的种类和数量。

盐类物质：

表面活性剂：广泛应用于工业、农业和日常生活中的表面活性剂，如十二烷基苯磺酸钠等，进入土壤后，可能会改变土壤颗粒的表面性质和土壤的物理结构，影响微生物与土壤颗粒的相互作用以及微生物的生存空间。同时，表面活性剂可能对微生物细胞具有一定的毒性，干扰微生物的细胞膜功能，抑制微生物的生长和代谢，进而影响土壤微生物的多样性。

多环芳烃类：是一类具有多个苯环的有机化合物，如苯并芘、萘等，具有较强的毒性和稳定性。它们进入土壤后，会被一些微生物作为碳源和能源利用，但同时也会对许多微生物产生毒性作用，抑制其生长和繁殖，从而改变土壤微生物群落结构和多样性。此外，多环芳烃的降解过程会消耗土壤中的氧气和营养物质，间接影响其他微生物的生存环境。

抗生素：农业生产中使用的抗生素以及人类和动物排泄物中残留的抗生素进入土壤后，会对土壤微生物产生选择压力。低浓度的抗生素可能会促进一些具有抗性的微生物生长，而抑制敏感微生物的生长，导致微生物群落结构发生改变；高浓度的抗生素则可能对大多数微生物产生毒性作用，降低微生物的多样性。长期暴露在抗生素环境下，土壤微生物还可能逐渐产生耐药性，进一步影响微生物群落的功能和稳定性。