控制储存环境湿度：复合碳源易吸潮结块，应密封存放于干燥环境，相对湿度建议≤60%。可以使用除湿设备控制储存环境的湿度，或在储存容器中放置干燥剂。

避免光照：部分复合碳源中的成分，如有机酸、糖类等遇光易分解，所以需用不透光容器存放或存放在暗处，防止阳光直射。

保持适宜温度：一般来说，复合碳源的***佳储存温度为 4℃-25℃。温度过高会加速降解，例如导致甲醇挥发、葡萄糖褐变等；温度过低可能使部分复合碳源冻结、结晶，影响其物理性质和使用效果。如果在 3℃-10℃的低温环境下，且复合碳源本身没有冻结、结晶等问题，其储存期限可能会延长至 15-18 个月。

确保密封：液态复合碳源需完全密封，防止挥发或与空气反应。粉状复合碳源如葡萄糖，建议充氮保存，避免氧化结块。对于已开封的复合碳源，若未使用完，应及时密封好，减少与空气和湿气的接触。

采用合适的包装和储存容器：选择耐腐蚀、抗震、密封性好的包装容器，如塑料桶、不锈钢桶等。对于大包装的复合碳源，开封后可分装至小容器，这样能减少产品与空气和湿气的接触面积。

添加稳定剂：部分液态复合碳源可加入少量防腐剂或稳定剂，如在乙酸中可加入苯甲酸钠，但需注意添加剂的使用量和安全性，应符合相关规定。

分类存放并定期检查：不同种类的复合碳源应分开堆放，并保持一定的安全距离，避免与不相容的物质混合存放，以防止发生化学反应。同时定期检查复合碳源的状态，包括外观、气味、pH 值等，如发现异常应及时处理。