温度：温度对复合碳源的稳定性影响较大，高温会加速其降解反应，例如一些含有机酸、糖类成分的复合碳源，温度过高可能导致其发生褐变等反应，一般***佳储存温度为 4-25℃。

湿度：复合碳源易吸潮，尤其是固态或粉状的复合碳源，在高湿度环境下容易结块，甚至可能滋生霉菌，影响其质量和使用效果，相对湿度建议≤60%。

光照：部分复合碳源中的成分遇光易分解，因此应使用不透光容器或存放在暗处，避免阳光直射，以防止其有效成分因光照而发生分解反应，降低碳源的有效性。

密封情况：复合碳源需要密封保存，以防止挥发或与空气发生反应。液态复合碳源若不密封，可能会导致溶剂挥发，浓度发生变化；同时，空气中的氧气可能会氧化复合碳源中的某些成分，影响其性能。