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分子结构：
非离子聚丙烯酰胺：分子链上不带可电离的基团，完全由丙烯酰胺单体聚合而成，分子结构较为规整，呈线性或支化状。
阴离子聚丙烯酰胺：分子链上带有负电荷的基团，如羧基（-COOH）或磺酸基（-SO₃H）等，这些负电荷基团使得阴离子聚丙烯酰胺在水中能够电离，产生带负电的离子。
电荷性质：
非离子聚丙烯酰胺：在水中不产生离子，呈电中性，与其他物质相互作用时，主要依靠分子间的氢键、范德华力等非离子性作用力。
阴离子聚丙烯酰胺：带有负电荷，在水中会与带正电荷的离子或物质发生静电相互作用，在絮凝、沉淀等过程中，与带正电颗粒结合的能力更强。
溶解速度：
非离子聚丙烯酰胺：溶解速度相对较慢，一般需要在常温下搅拌较长时间才能完全溶解。
阴离子聚丙烯酰胺：溶解速度较快，在常温下搅拌较短时间即可溶解。
分子量：
非离子聚丙烯酰胺：分子量区间通常在 400 - 1200 万。
阴离子聚丙烯酰胺：分子量区间在 400 - 2500 万，部分产品可达 3000 万。
适用场景：
非离子聚丙烯酰胺：适用于处理含有机物较高、pH 值为中性或酸性的污水，对高盐废水适应性较强，也常用于造纸工业中提高纸浆滤性、增加干纸强度等。
阴离子聚丙烯酰胺：在处理含有大量悬浮物、胶体物质以及带正电荷污染物的污水时效果显著，广泛应用于钢铁厂废水、电镀厂废水、冶金废水、洗煤废水等工业废水的絮凝沉降、沉淀澄清处理，以及饮用水的澄清和净化处理。
